Balık atıkları, yüksek organik yük ve protein içeriği sayesinde kompost ve biyogaz üretiminde değerli bir hammaddedir. Doğru proses tasarımı ile koku ve hijyen kontrolü sağlanarak verimli şekilde işlenebilir.

Balık atıkları kompost sistemlerinde tek başına değil, genellikle karbonca zengin dengeleyici malzemelerle birlikte değerlendirilir. Böylece nem dengesi, ısı yükselmesi ve koku kontrolü daha sağlıklı yönetilir.

Biyogaz üretiminde balık atıkları yüksek biyolojik ayrışabilirlik sunar. Uygun ön hazırlık, kontrollü besleme ve hijyen yönetimi ile sistem verimi yükseltilirken proses güvenliği de korunur.